海军不是不按计划来运输这些俘虏，主要是海军这次遇见了麻烦，连施琅就赶回了昌化。这事要从十天前说起，海军的运输船队运送第一批俘虏回琼州时，由于要运送建筑材料到威海，回去的船队就有许多空船，为了不让船放空，就在杭州湾采购了大量的棉花、生丝。结果船队在经过琉球海峡时，结果遇见了海盗，就是海盗，而且是西洋海盗，因为对面气势汹汹逼上来的是三条盖伦船，从望远镜里可以清楚的看见船上红毛人。护送船队的两艘军舰和一条天使号根本没有重视，因为弗朗机也有船队在海关备案交税。直到这三条船升起了海盗旗海盗旗又称骷髅旗。骷髅旗——也就是一个骷髅加上两根交叉骨头的旗帜绝对是海盗的标志。虽然来源已不可考，但很多人认为这个词其实是来自法语单词JoLI RoUGE，“鲜艳的红”的意思。从前的海盗们用这个词来描述船桅上高高飘扬的血色旗帜。多数情况下，海盗在追逐猎物时，升起白色旗帜，表明身份——有时猎物会因此降下自己的旗帜而屈服；如果猎物拒绝投降，则升起黑白两色旗帜，表明意图；红色旗帜会桅顶飘扬，意思是一旦捕获猎物，不留任何活口。
海军士兵一见血红的海盗旗又惊又怒，没有想到这里居然会遇见海盗，这些海盗居然没有任何交涉就要不留活口。护航的舰队的领队是琼州十号的船长何三九，马上下达了作战命令，轰隆隆的炮声就响了起来，海上打炮双方都没有什么准头，一阵炮声过后双方却没有什么损伤。两条福船正准备调整姿态继续射击，却发现三条海盗船居然直扑运输船队，何三九一看大急，刚才迎战时忘了自己在护送运输船队，现在追上去已经不可能了，急忙用旗语命令天使号追上去缠住这三条海盗船。天使号马上追上去向这些海盗船贴着水面发射了三枚火箭弹，但都被躲过，看样子对方对亚洲军海军的作战方式有一定研究。这时两条褔船已经追了上来，对着海盗船一阵猛轰，终于把三条海盗船赶走。何三九赶忙打出旗语让运输船队尽量靠在一起，满帆前进。这时三条海盗船再次扑向运输船，何三九在第一回合吃了亏，不再急于攻击对方，而是不断调整姿态阻挡海盗船进攻运输船，一来二去双方的距离就拉到了一百米左右，双方几乎同时开炮。硝烟散尽，两条福船的船帮上多了不少窟窿，一条福船桅杆已经折断，十多个士兵当场死亡，三条海盗船也没有好到哪去，原来站在甲板上的人被一扫而光，船帮上也多了几个窟窿眼，其中一条船被弹片划断了船帆的缆绳，船帆也落了下来，暂时失去了动力，天使号一见有机可乘，飞快靠拢贴水连发三枚火箭弹，打固定靶那就准多了，三声爆炸后这艘盖伦船就变成了火把。但另外两条盖伦船又故技重施扑向运输船，双方你来我往，打了一个势均力敌，西洋水手操舟水平高，但火炮破坏力不足。亚洲海军操舟火炮厉害，但防守面积大，旁边还有一天使号救场，也不落多少下风。
但这里离大员太近，也不知道还有没有其他海盗船过来，必须尽快搬救兵。何三九见对方暂时也没有能力拿下自己，打出旗语让天使号回琼州搬救兵，自己两条福船继续与海盗船周旋。天使号接到命令就满帆前进，居然跑出了历史最高记录，在当天晚上就赶到了琼州港，稍作补给又向儋州而去，幸运的事他们没有走多远就遇到了一支三条福船一条天使号的巡逻船队。巡逻船队听到报告直接就向琉球海峡赶去，原巡逻的天使号回儋州港继续搬救兵，安排巡逻队巡逻。
这支巡逻船队组织的救兵连夜航行，终在第二天上午赶到战场，当他们赶到时，海面上居然多了三条盖伦船，现在五条海盗船正围着两条福船进攻，两条琼州号已经被打得弹痕累累，只能不断的用火炮优势不让这几条海盗船靠拢近战，炮弹也快告磐，但他们还在苦苦支撑。要不是遇见巡逻队，他们绝对支撑不到救兵的到达，可能会全军覆没，亚洲军也不可能发现是谁袭击了他们。三条巡逻船一见情况危急，也不管什么战术，直接冲进战团就开炮，十条海船战成一团，炮声隆隆，硝烟弥漫，这海战一直打到傍晚，十条船都受到不同程度的损伤，五条海盗船见没办法达到目的，估计亚洲军还会有救兵，不得不离开，亚洲军要为运输船队护航也不敢去追，于是双方一个向东一个向南分道扬镳。