就在萌指在飞往纽约的路上，他又收到了一份令人忧心的情报。
位于巴哈马的航空母舰舰队莫名失联，在侦察卫星侦查后，发现该舰队已经被莫名其妙的摧毁了，这让萌指心头一紧。
虽说他在佛罗里达州重建了一支舰队，可此时，巴哈马这支舰队的覆灭却让他重建的这一支舰队成为了美国大西洋上唯一的舰队。
不过此时的萌指也来不及多想，因为他所乘坐的飞机即将到达纽约，他还需要解决纽约的问题。
当萌指赶到纽约附近时，手下部队的一支先遣队已经赶到了纽约北部市区。
当萌指走进位于前线的指挥所时，副官在看见萌指的到来后，赶忙向萌指汇报了先遣队侦察到的情报。
“指挥官，先遣小队发来了一些令我们困惑的情况，这是具体的情报，你看看就知道了。“
说完，副官将手中的交给萌指，萌指接了过来。
报告上说先遣队在赶到纽约北部后一切平静，整个市区似乎没有被苏军占领的痕迹。
不过就在先遣队在北部市区建立基地后，突然有一队市民被一名美国大兵带来，并不由分说的开始向先遣队开火。
先遣队无奈向这群市民开火，并将这份情报告知了前线指挥部。
“这么看来，你认为我们在之前的侦察队也有可能是受到了市民的袭击，或者更严重的说，他们已经被某种物品迷失了心智？”
萌指问了问副官。
“我不敢保证，但是肯定与这件事情有关系。”
副官回答道。
萌指在思考过后，便先让先遣队找找附近有没有什么能用的物资。
在过了一会后，先遣队报告他们发现了一座海军船坞，看样子还可以正常使用。
于是萌指下令建造海军，他决定先行前往侦察队最后消失的地方查看，寻找侦察队的踪迹并询问情况，毕竟若能直接得到情报，总比什么都不知道然后莫名被控制要好。
在海军建造完毕后，萌指先让驱逐舰侦察了附近的海域，结果，驱逐舰的侦察报告与之前的先遣队如出一辙，他们也遭到了来自美军军械驱逐舰的攻击。
虽说在战争中被缴获军备实属正常，但是在图纸未泄露的情况下，海军很难被缴获，更别说苏军的美械数量也比正常的缴获多了不少。
于是，萌指在让海军击沉最后侦察队出现地点附近的海岸防守后，便急忙准备了一支小队前去寻找侦察队，他现在迫切需要知道究竟发生了什么，未知的东西永远是最可怕的。
为了以防万一，萌指甚至将这次行动派来的三辆m1一同派了出去。
在部队逐渐靠近消失地点附近后，他们再次遇到了疑似被控制的斗牛犬坦克，不过这位斗牛犬坦克驾驶员似乎抵挡了一部分控制，告诉了萌指一个重要的讯息：不要靠近。
但是一句不要靠近无法让萌指放弃收复纽约，若是这里真的有什么不为人知的秘密，萌指就更需要将其发掘出来。
当寻找侦察队的众人赶到后，他们终于发现了侦察队，不过为了以防万一，萌指还是让部下摆出防御阵型，并鸣枪示警。
果然，在鸣枪示警后，侦察队果然对萌指的部队发起了进攻，就在侦察队被众人消灭后，副官此时也交给了萌指一个情报。
“指挥官，我们在零一座小岛上发现了一些幸存部队，他们告知了纽约双子塔附近有一座奇怪的建筑，我们的侦察卫星也已经侦察到了这座不明建筑物。”
“并且，我们的卫星也发现了附近的一个防御薄弱的登陆点。”
副官将地图推向地图上的一个区域。
萌指在获得一切情报后，便召集舰队将登陆点肃清，随后运输部队登陆。
而就在登陆后，副官又告知了萌指一件紧急的事情。
“指挥官，那个装置似乎有增大功率的迹象，我们不确定增大功率会发生什么，所以请您快点。”
在听到这一切的萌指不得不急忙肃清了登陆点附近的苏军，并且沿着海岸线推进。
在推进的过程中，他也遇见了一些美军，只不过这些美军与之前的一样，遇到他们就会开火。
萌指不愿将枪口指向己方军队，所以，萌指不得不命令部队绕过这些部队，若是绕不过，也只能狠心杀害。
一路推进过后，萌指的部队推进到了不明建筑西北部，在这里他的部队意外地遇见了一支美军小分队，并且与一名更加意外的人进行了通话。
“克里斯将军，是您吗？”
“呃，我们见过吗？”
虽然当时与萌指共同防守着华盛顿，不过因为时间太短，又因为萌指当时为了防御忙的不可开交，所以双方并没有真正的见过面。
“我是在华盛顿与您一起防御过的将军啊。”
“啊，我想起来了，原来是你啊，听说华盛顿能守住全是靠你的精湛指挥了，即使早已被关押在这里，我也在这群苏军嘴里听过你最近的做的事。”
“对了，待会再聊天吧，您知道双子塔下面的那玩意是什么吗？”
“说来惭愧，我自从纽约战败后就一直率领着抵抗部队，就在一段时间前，我手下大部分士兵突然叛变，随后我就一直被关押在这，我也不清楚这东西是哪来的。”
在发现得不到什么有用的消息后，萌指便将克里斯安置好，决定自己去占领这座建筑一探究竟。
在利用坦克打破后面的围墙后，萌指命令部队消灭不明建筑附近的部队后，便让工程师占领了这座建筑。
随后，仿佛是一阵无形的波掠过上空，在美军恢复心智并逐渐联系上后，萌指发现纽约市内的所有苏军也纳入了自己的指挥下。
就在萌指准备命令手下将所有苏军关押起来时，负责控制这座名叫“心灵信标”的工程师突然失去了对这玩意的控制，并告知了这座心灵信标即将过载自爆的消息。
来不及关押苏军萌指只得下令卖掉苏军大部分的防御以及生产建筑，随后，心灵信标自爆，所有苏军恢复了控制，并开始在纽约市区与美军混战了起来。
不过在萌指的指挥下，纽约的苏军被轻易消灭，纽约就这样被萌指收复。
不过得知了苏军真正目的的萌指在让副官寻找美国境内的各种不明建筑后，又在芝加哥与圣路易斯各发现了一座，并且相比心灵信标来说更加巨大。
经过情报部门的推测，这个玩意或许能让整个美国中部甚至整个美国被控制，不得已的萌指也只得命令大部分部队前面去消灭这个足以毁灭美国的威胁。
然而他不会想到，这个威胁背后带来的损失，将让整个美国从此无力回天…