本能寺外，叶银城与战神壬生京四郎到达，他们的目的就是引开武神和蓝天碧云，好让明智光秀马上行动。
叶银城抽出白银剑，剑气化作数十丈巨型光带，剑芒嗞嗞吐着锋利气息。他的声音洪亮响起，声震直达明智光秀埋伏之处：“武神阁下，蓝天剑，请接招！速速出来一战。”巨大的白光剑气直接斩向本能寺。
庞大的剑气威压，令本能寺内众人大惊。梦天大喝：“手下败将！你准备再逃跑么？！剑神！！”梦天肉身和元神化身巨大白炽刺眼的剑神冲天而起。“哐！！”令夜空撕裂，震耳欲聋的碰撞声，白银剑的白光剑气直接被剑神冲碎零散。
东瀛大地第二次出现万兵臣服的“剑神！”。半空化身剑神的梦天一下子发现叶银城和战神，他震天喝道：“两个鼠辈，终于敢现身了。来了，就别走了。驭剑飞天！”巨大的剑神周边旋转绽放出一柄柄高光利剑，仙剑剑神加万剑诀对准叶银城和战神一闪穿插过去。
叶银城惊呼：“你领悟达到剑神境界了！”他尚未知晓梦天境界再突破。没时间给他们思考，叶银城与战神早已计划好，防御第一的银城剑法剑光球立马生成；战神的金翅鸟王者剑招----转也已经施展。两大绝顶高手共同联合抗衡梦天的剑神。
招式对碰，霎时白亮的剑光如原点爆炸，刺眼的白光把整个京都的黑夜都打破了，亮如白昼。
梦天的剑神与两大高手对轰后，原地无法撼动，仅是周边环飞的众多利剑破碎了。叶银城的剑光球及战神却原地倒退。
叶银城与战神乘势飞退，叶银城哈哈大笑道：“天下第一蓝天剑不过如此。凭你还留不下我！”叶银城和战神突然就往东西方向分开跑了。
梦天哼道：“鼠辈，出现了就别再想跑了。”他恨叶银城更甚，所以立马朝叶银城追去。
同步瞬间，本能寺内赤发红眼的武神鬼眼狂刀快速的身影朝战神壬生京四郎方向追去，道：“小天，战神这边交给我。”
如云看了一眼织田信长，焦急的眼神一眼就被信长看穿了。久经大风浪的织田信长笑道：“碧云刀盟主，放心不下梦天盟主就一起去吧，这样也能尽快把敌人制服。”
如云一听也不再犹豫，闪电的身法化作一道流光变幻向梦天与叶银城追去。远远叶银城的声音响道：“好！蓝天碧云同来，我叶银城又何惧！”
另一方，战神壬生京四郎的声音也高高响起：“喔尼米呢q，你我再次公平一战，很好！”
可惜，梦天与武神不知道他们的这两声高呼是向潜伏的明智光秀大军的一个信号：蓝天碧云与武神已经离开织田信长身边！
明智光秀远远收到震天的信号，时机已到，立马对全军下令：信长检阅我们的时候到了。敌在本能寺，出发！他命令明智左马介光春攻本能寺，明智治左卫门攻二条城和织田信忠泊宿的妙觉寺，明智光秀坐镇三条堀河。本能寺很快被重重包围，第一重四天王但马，第二重村上和泉，第三重三宅式部；且本能寺周围所有的出口都有200~300人负责把守。六月一日子时，明智光秀军团完成包围工作。
本能寺内，织田信长听到四周的动静与骚乱。最初还以为是侍卫们吵架，刚才爬起身准备斥责，忽听铁炮发射之声，阵阵鸣响。他马上明白了，是有人想反叛了，他对小姓森兰丸说：“定然有人反叛，去，看看叛者是谁？！”
森兰丸出去了一会儿，匆匆跑回禀报：“是桔梗旗印，是惟任日向守的部队！”信长大惊：“明智光秀吗……”
森兰丸所指的，正是信长麾下大将明智光秀，他当时官位为正六位下日向守，因曾通过信长向朝廷求得“惟任”的古老姓氏，因此习惯被称为“惟任日向守”。
知道明智光秀谋反后，织田信长亲自上阵，这时候本能寺已经炮火通天，到处都是大火包围，东瀛战国时代是最早用上火炮的。信长率小姓众奋战，但始终是寡不敌众。
信长众人边战边退，御马屋附近马郎、藤八、岩、新六、彦一、弥六、熊、小驹若、虎若等二十四人战死。
再退到御殿内的时候，森乱、森力、森坊兄弟三人、小河爱平、高桥虎松、金森义入、菅屋角藏、鱼住胜七、武田喜太郎、森兰丸等剩余小姓均战死。
不远的妙觉寺的织田信忠率本队1500人想前往救援其父，被明智治左卫门阻击，于京都二条城内自杀。
织田信长见大势已去，退入内室。不久以后，内室燃起熊熊的火光，一代霸主就在烈火中切腹自尽，灰飞烟灭。
本能寺之变从深夜到六月二日凌晨，这短短两三个小时改变了整个战国的历史。
明智光秀见织田信长已死，心中大喜，竟然真的成功了！但他没有被眼前的胜利冲昏了头脑，他立马命令所有人马立马撤离京都，返回安土城，要占领安土城。明智光秀害怕呀，害怕武神和蓝天碧云折回来。碰到他们，多少兵马都是没命的下场。
虽然除去了织田信长，但明智光秀心中还害怕一人对他胜利的成果产生威胁，那就是还在和毛利辉元对抗中的羽柴秀吉。明智光秀边往安土城退去边修书给支援高松城的毛利辉元，说织田信长已死，明智光秀愿与他合作，千万别放弃高松城。目的显然易见，就是想毛利辉元牵制住羽柴秀吉，待他在安土与京都站稳胜利的脚跟。
分别被武神与蓝天碧云追杀中的战神壬生京四郎与叶银城同时看到京都本能寺方向火光通天，均哈哈哈大笑道：“成功了！信长已死，东瀛武道从今天开始就是我们的天下！”
武神与梦天如云大惊，糟糕！调虎离山。知道战神与叶银城的目的，这个层次如果一味逃，自己也是没办法把他们击杀的。梦天如云与武神同时折返本能寺，看到现场灰飞烟灭、尸横遍地，三人一脸铁青！懊悔莫及。武神鬼眼狂刀对天怒吼：“到底是谁？我要他碎尸万断！！”武神震怒整个京都的声音，吓得逃往安土的明智光秀都心惊肉跳，冷汗直冒。