但三天之后，位于地球的胜利舰队一方在还没有解决达卡市这看见就让人感觉到头疼的混乱局面时，就因为更重的紧急事项而不得不离开达卡。
因为在第三新东京市再一次出现了代表着使徒降临的警报，有一个使徒出现但却并不是在第三新东京市，而是在宇宙之中和地球保持着相对轨道，一直悬停于第三新东京市上方，有着比起其他使徒更为巨大的体形，两个彩色的翅膀加上一个大眼睛，还真有点抽象的感觉。
而根据NERV的资料来看，这个使徒本身就是一个具有AT立场的超级炸弹，一旦从宇宙中落下并且爆炸的话，后果将会比从宇宙丢下殖民卫星更加的可怕。
为了解决抵抗这个使徒同样拥有AT立场的EVA的力量就成为了必须，根本没有任何耽搁的在收到消息的第一时间就离开了达卡，可这样一来达卡这边也就不具备太多的防御力量了，所以为了避免联邦趁着这个时间向达卡发动攻击，萧然便主动的留了下来，和咲，积古斯三人配合少数愿意加入统合的部队镇守着达卡。
剩下的人也并非全都会前往达卡市，比如巴萨克和罗，两人就离开了胜利舰队选择单独行动，朝着西班牙之中罗兰曾经提到的联邦基地急驰而去，目标就是摧毁掉这个G猎犬部队的重要基地，再一次的震慑那些还在左右摇摆不定的家伙们，同时也算是正式开启对联邦力量的打击行动。
而这次开始以罗和巴萨克两人单独进行的打击行动，则会让联邦感觉到什么才是A级机师能够带来的恐惧，事实上要不是萧然一直离不开达卡，要留在这里作为最强大的威慑力量镇压一切，说不定萧然还真直接驾驶破晓离开，第一站就会选择联邦军总司令部，快刀斩乱麻不讲道理的彻底解决。
没有了罗和巴萨克，萧然，积古斯，咲全部留在了达卡，在加上宇宙那边的行动就已经带走了一大批人，以地球方面胜利舰队的战力而言在最高端的力量也变得薄弱起来，不过整体上还有着亚捷那尔第一中队，EVA小队，AS小队，阿姆罗，兜甲儿，流龙马，破岚万丈，还有重新加入的利迪等等人手，只是应对一个使徒的话应该并不是什么问题，真正所需要担心的是还会不会出现什么其他意外的情况。
但是在舰队抵达第三新东京市之前，在解决了安布利欧之后就回到龙之国度内的巫女公主莎拉和她的两个伙伴就已经先行抵达了第三新东京市，而许久没有出现的铁也也同样出现在了第三新东京市里。
使徒的威胁在众人的协作努力之下成功击破，但大和号却遭受到了不明仿生机器人的入侵并损坏了作为主要能源的量子波动引擎，未知原因的损坏使得量子波动引擎难以维持大和号的正常能源供给，而为了维修大和号，除了铁也在战斗结束之后直接离开之外，胜利舰队也就留了下来。
但紧接着葛迪姆再次出现，是比以往更多数量的葛迪姆，并且比起之前单纯的无礼攻击，这一次出现的葛迪姆和之前出现的情况完全不同，竟然在战斗之中采用了诱饵的方式先后三次传送了突击部队对大和号进行攻击。
而在这场战斗中，还出现了葛迪姆势力中更为高级的指挥官机体，一个叫做洁美的指挥官同样登场，新的指挥官机完全达到了A级机体的程度，丛云总司也在葛迪姆指挥官洁美的忽然进攻之下受到重伤，梵格雷也一起被击破，而一直在大和号中由奈茵悄悄建造起来的两台梵格雷的后继机的也正式登场。
一台是拥有着极高速度和火力，强调远程打击的梵格尼斯，一台是拥有着更高力量火力更强，装甲也更后但速度上却逊色不少的古朗梵格，两台机体全是奈茵所主导研发制造出来的机体，专门为了丛云总司而设计。
当然，只是依靠奈茵一个人肯定无法制造出这样的两台机体，但是罗，雷纳德，还有一些其他愿意帮助奈茵的人，也都在其中下了不少功夫，要知道这两台机体中不少的组件部件可都是从燃烧军团号的机械师设备里弄出来的，罗也满意的得到了这两台由奈茵所设计机体的全部资料。
最终丛云总司拖着受伤的身躯选择了和梵格雷更相似的梵格尼斯，在其他人的协助下成功的将所有人葛迪姆全灭于第三新东京市里。经过了这场战斗，最终在打扫战场的时候众人才发现了一个很大的问题。
如今大家所遇见的葛迪姆机体总共只有三个型号，第一个类似于MA一样的型号是最低级的杂兵级，这种机体只是用AI来控制，这种机体算是C级。
而第二个型号则是队长机，等级为B级，大多数同样是由AI来控制，但那个和丛云总司有些纠缠的葛迪姆机师，之前明明就被击破但却又在这场战斗中再次出现，简直让人觉得莫名其妙，而第三种这是最新出现的指挥官机。
这种指挥官机大家虽然对于机体的等级不存在什么概念，不过当战斗的记录落到萧然眼中的时候，萧然很快就感觉到了这台机体绝对是一台A级机体，一台只适合在大规模战斗之中使用的A-级机体，只是运用方向上更符合指挥官于后方战斗进攻。
但只是火力支援型机体的A-级指挥官机体而已，其实并不值得萧然太过注意，但真正的问题在于清理队在对机体进行回收的时候，愕然的防线这台机体的驾驶员，也就是叫做洁美的人竟然是一个仿生机器人，曾经和丛云总司在火星上战斗的那个葛迪姆机师也同样被挖了出来，而且又是一具仿生机器人，这时大家才明白为什么明明当初被击破的人竟然又再次出现。
正也是因为仿生机器人的缘故也让大家对葛迪姆的重视又多了几分，特别是在对待葛迪姆的态度上也严正了很多，因为没有人能够说得清楚葛迪姆到底还有多少像是洁美这样的仿生机器人，毕竟可是在一瞬间就把梵格雷给击破的家伙啊。