三年的时间很快就过去了，此时距离夜神月离开木叶已经有三年的时间了，在这段时间中当然也发生了很多的事，不过这些事都被表面上的和平所掩盖住了，所以大家也都没把这些小事当成什么大事。
首先，木叶的小强一代都已经成为了可以独当一面的忍者了，而不是当初那些个在中忍考试中才发出一点光芒的下忍，首先不得不说的就是日向家的天才忍者，日向宁次，居然年纪轻轻的就已经到了上忍的程度，让各国都不敢小觑木叶的天才。
而除了宁次以外，其他的小强们也都得到了中忍的称号，不过他们每个人都几乎有着不下于上忍的实力，毕竟上忍这个称号是需要大量的任务才能从中忍提到上忍的，不过这不代表一个中忍不可以有上忍的实力，现在众小强们距离上忍，估计也只是差一些经验，还有任务的累积罢了。
纲手还是如同原着中一样，收了两个徒弟，自静音这个记名弟子，加上夜神月这个赫赫有名的亲传弟子之后，纲手又有了两个亲传弟子，那就是木叶小强中的春野樱，还有井野。
值得一提的就是，夜神月在离开木叶之后曾经回到木叶一次，回去的那一次不禁看了自己的老师纲手姬，还有卡卡西等人，还看了自己的师傅的师傅，也就是当初的三代火影。
在纲手姬，还有三代的谈话中，众人也知道了夜神月叛逃的原因。但是在众人要求夜神月回到木叶的时候，夜神月却是拒绝了，其中具体是什么原因，也不明说了，总之夜神月是背定这个叛忍的名头了
不过当夜神月把雷神之剑给三代看了看之后，三代居然流出了眼泪，想来是想念自己老师，也就是二代火影了吧，毕竟这可是二代火影的遗物。不过当夜神月说要把雷神之剑给三代的时候，三代却是拒绝了。
三代说“宝剑配英雄，现在我已经拿不动这把剑了，希望你能够拿起这把剑来保护木叶，让火的意志永远传下去。”
其实以夜神月的心机也早就想到了这一点，毕竟这是影水留给自己的东西，夜神月也不舍得这么就给三代，所以夜神月就自己收了起来，没有半点的客气。而对于自己的两个新的师妹，夜神月并没有见他们，可能是有代沟，或者是别的原因吧。
自来也在两年半之前就带着鸣人出游了，不过鸣人还是一直对夜神月与佐助叛逃的事耿耿于怀，临走的时候还说，一定要增强自己的实力，把夜神月找回来，同时把佐助带回来。
不知道为什么，在这三年的时间内，各大忍村之间除了木叶与砂忍村之外，其他忍村都有一些小摩擦，这可能就是当初ye神月在那半年内挑拨的作用吧，别的不说，就说岩忍村与雾忍村的梁子，也是结下了，而且真正知道内幕的人，也不会把真实的情况说出来。
而两大忍村的摩擦也越来越大，后来不知道怎么得，因为八尾人柱力的原因，云忍村居然来开始加入这场摩擦，这点摩擦虽小，但是在有心人的眼里可就不一样了。
在表面的平静下，已经掩盖了太多的暗战，但是其中还是有很大的两件事，第一件就是雪之国雪忍村的真正的成立，让大家都知道在这个世界上又多了一个忍村，而且还是有一个影级强者的忍村，而这个忍村的村长，居然就是雪之国的女皇，副村长则是那名影级强者，具体的名字，大家也都不知道，只是知道那个影级强者是个傀儡师。
第二件大事，就是不知道为什么，各忍村的忍术卷走总是会短时间的消失一段时间，刚开始的时候大家都没当回事，但是后来居然在各个忍村都发生这样的事，慢慢的也就传开了。
而这件事的主角，也正是本书的主角，夜神月了。在两年半以前，夜神月知道了通往“天忍”的道路，从那之后，夜神月就开始整理自己的忍术，终于把所有的忍术整理完之后，夜神月又开始研究起了自己的那些重要的东西，比如君麻吕的血液什么的。
在这些研究上，夜神月当然也得到了一些回报，最令夜神月高兴的，就是在砂忍村再次偷到的一个卷轴中，发现的生命力的传输。生命力的传输是一种可以制造活傀儡的未完成的忍术，不过这个忍术的另一个效果就是，可以让一个活人把自己的生命力传给一个死人，从而令那个死人复活。
知道了这个忍术之后，夜神月也就大概知道了生命力的秘密，从此长生不老和永远年轻对于夜神月来说已经不再是梦，只不过需要很长的时间来研究罢了，不过夜神月还是依靠它完善了自己的一个忍术，再次就不多说了。
而且，夜神月得到的，那不止是这些而已，因为夜神月此时已经真正的踏入了天忍的行列，成为了真正的顶级强者。